Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms