Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo3Q2TJ95 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo3Q2TJ95 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms