Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edem3Q2HXL6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edem3Q2HXL6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms