Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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Shroom4Q1W617 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shroom4Q1W617 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms