Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms