Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd2Q149F1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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