Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3ip1Q149C2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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