Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930480E11RikQ0VG34 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms