Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms