Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1bQ0MW30 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms