Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms