Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms