Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms