Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm3Q08189 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms