Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cnn1Q08091 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cnn1Q08091 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cnn1Q08091 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cnn1Q08091 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnn1Q08091 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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