Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf3Q07104 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms