Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms