Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms