Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal1Q05A62 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms