Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcn1Q05186 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms