Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms