Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms