Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax5Q02650 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax5Q02650 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms