Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snai1Q02085 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms