Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1cQ01815 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms