Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms