Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja5Q01231 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms