Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms