Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VldlrP98156 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VldlrP98156 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms