Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn1bP97952 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms