Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlkP97793 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlkP97793 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlkP97793 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlkP97793 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlkP97793 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlkP97793 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlkP97793 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms