Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cry1P97784 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms