Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cited1P97769 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms