Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smyd1P97443 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms