Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3aP97351 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms