Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms