Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms