Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx1P80205 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms