Protein–RNA interactions for Protein: P70460

Vasp, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VaspP70460 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VaspP70460 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VaspP70460 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VaspP70460 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VaspP70460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VaspP70460 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VaspP70460 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VaspP70460 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VaspP70460 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms