Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh10P70408 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms