Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx3P70354 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms