Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms