Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NficP70255 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NficP70255 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NficP70255 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NficP70255 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.1 ms