Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms