Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UbdP63072 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UbdP63072 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UbdP63072 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms