Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab1AP62821 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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