Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhobP62746 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhobP62746 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhobP62746 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhobP62746 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhobP62746 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhobP62746 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhobP62746 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhobP62746 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhobP62746 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms