Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta2P62737 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms