Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpfP62307 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms