Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufm1P61961 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms